Biologie moléculaire. Houdini. NVIDIA 3080. Coronavirus vs immunoglobulines

Lien vers notre vidéo





C'est mon deuxième texte sur Habré. Il s'est développé sans heurts à partir du premier article " Biologie moléculaire et Houdini dans l'été du vingtième ".





Nous avons terminé notre nouvelle (deuxième) vidéo le 12 avril 2021, journée de l'astronautique. La date s'est avérée aléatoire - je voulais vraiment terminer le travail lundi. Mais cela s'est avéré être un match parfait.  





Va!





Voici un dialogue approximatif que Valeria (biologiste moléculaire) et moi avons eu au début du projet:





- Et faisons un doublage en anglais pour notre vidéo sur les immunoglobulines?





- Allez.





- Et remplacez le rotavirus par le coronavirus. Ils sont très similaires. 





- Oui.





- Nous n'aurons même pas besoin de refaire certaines scènes. 





- Oui.





- Et passons du rendu CPU au GPU. Ditch Blender en faveur de DaVinci Resolve. Le timing restera le même - une minute. Son et virus. Je pense que nous aurons terminé dans quelques mois.





- Ouais je suppose.





Nous avons réalisé la vidéo pendant 5 (cinq) mois. Je pourrais travailler 2 heures par jour de 12h à 2h du matin et pas tous les jours. La durée de la vidéo a été multipliée par 3,5. L'augmentation de la complexité du projet (par rapport à notre première vidéo) par mon Sensateur intérieur de Complexité est estimée à six fois.





On peut dire que l'ensemble du projet (partie non scientifique) est constitué de fragments qui sont vaguement connectés et donc ils peuvent être réalisés en parallèle. Idéalement, par des personnes différentes. 









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 Storyboard.  Le virus se fixe au récepteur cellulaire ACE2.
 . 2.
Storyboard.  Les cercles gris sont des cellules.  Les noirs sont des virus.  Blanc - immunoglobulines ou anticorps.
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Une scène dans différentes versions.
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RedShift. . GPU-, .





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RedShift

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3080 RedShift 2 5. ! Mantra, , 30 ( 16 , ). , ! RedShift. 





Redshift? Octane, Vray Arnold. Vray . 3dsmax . Arnold , Autodesk. Octane . RedShift — . . , Maxon, RedShift, . 





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RedShift , . instance . .





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RedShift.  Le shader est le même.  Particules à gauche.  Sur la droite se trouve la sphère.  WTF?
RedShift. . . . WTF?

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RedShift ( ) / :





RedShift.  Laissé sans instance d'objets.  À droite avec des objets d'occurrence (sphères ou particules). 
RedShift. . instance- ( ). 

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NVIDIA 3080 et RedShift.  Entre des mains habiles, 10 Go ne suffisent pas.  La géométrie non-instance bloque le rendu. 
NVIDIA 3080 RedShift. 10 . instance- . 

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Palette de couleurs de rouleau. 

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. 2. 1.





NVIDIA 3080. Redshift.  Rendu final 2k.  Modèle atomique du coronavirus.  Temps de rendu jusqu'à 3 minutes.
NVIDIA 3080. Redshift. 2. . 3 .
NVIDIA 3080. Redshift.  Rendu final 2k.  Modèle atomique du coronavirus.  Temps de rendu jusqu'à 4 minutes.
NVIDIA 3080. Redshift. 2. . 4 .
NVIDIA 3080. Redshift.  Rendu final 2k.  Une cellule épithéliale "caked" avec des copies du coronavirus (environ 150 000).  Temps de rendu jusqu'à 2 minutes.
NVIDIA 3080. Redshift. 2. «» (.150 000). 2 .
NVIDIA 3080. Redshift.  Rendus finaux 2k.  SSS + DOF + Flou de mouvement.  1 à 4 minutes par image.  Vignettage ajouté en post-production.
NVIDIA 3080. Redshift. 2. SSS + DOF + Motion Blur. 1-4 . .

3080 RedShift, , , . . , 7 . , . . . . , 5 , 30. . 200 ( 10 ) 20 . 2 . . 





. . , . NVLink ( ) — ! 





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Houdini

Houdini. . , , . , x = 5 — 2 . , , . , . 





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Wikipédia.  Membrane cellulaire.
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Endocytose.  La façon dont le virus pénètre dans la cellule.
. .

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. 27000 . . . . . 





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DaVinchi Resolve

Blender. . ? Windows. — . 





  1. After Effects + Premiere Pro.





  2. Sony Vegas + ?





  3. Davinci Resolve + Fusion.





  4. Nuke + ?





  Resolve. -, . . , . Fusion Resolve. . , — . Fusion — , Houdini. -, — - . 





DaVinci Resolve.  Voici à quoi ressemble la quatrième version de la vidéo.  Nous avons terminé le projet le sixième.
DaVinci Resolve. , . .

Resolve exr. .





. , RedShift , -?





DaVinci Resolve.  Coronavirus.  Rendu noir et blanc colorisé. 
DaVinci Resolve. . - . 
DaVinci Resolve.  Coronavirus et surface cellulaire.  Le virus se fixe au récepteur ACE2.
DaVinci Resolve. . 2 .
DaVinci Resolve.  Endocytose.  Le coronavirus pénètre dans la cellule. 
DaVinci Resolve. . . 
DaVinci Resolve.  Immunoglobuline IgG.
DaVinci Resolve. IgG.
DaVinci Resolve.  Immunoglobuline IgG.
DaVinci Resolve. IgG.

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. . Houdini. . , : GROMACS, CHARMM, NAMD . , , — , , . 





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PS 





Si vous avez des tâches dans lesquelles nous pouvons accomplir plus ensemble, écrivez-moi.





Pendant que je travaillais sur l'article, le concours Biomolécule s'est terminé . Nous avons participé avec notre première vidéo. Et il a remporté un prix - un abonnement d'un an à OctaneRender.








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