Construire un cerveau à partir de zéro: modèles mathématiques en neuroscience

Pendant des millénaires, l' humanité s'est inquiétée du fonctionnement du système nerveux: des tentatives ont été faites pour comprendre comment se produisent la perception et l'apprentissage, ce que sont les émotions et la conscience, quel rôle elles jouent, comment elles sont apparues au cours de l'évolution, quelle est l'influence de divers facteurs externes et internes sur le développement et la formation du système nerveux. systèmes humains et autres animaux. Tous ces sujets passionnants sont abordés d'une manière ou d'une autre dans les neurosciences et les disciplines connexes.

La neurobiologie est la science qui étudie la structure, le fonctionnement et le développement du système nerveux chez l'homme et l'animal. La science du cerveau est une discipline plus étroite dédiée au cerveau humain. La neurobiologie englobe différents niveaux d'organisation - du moléculaire au systémique, passant en douceur à la biologie moléculaire et à la biochimie d'une part, et à la neuropsychologie (science à l'interface avec la psychologie) d'autre part.

Certaines personnes, comme dans des temps immémoriaux, continuent d'affirmer qu'il est impossible de comprendre le travail du cerveau, ou elles nient que le cerveau donne naissance à notre esprit et à notre conscience, etc. Malgré tout cela, en réalité, les sciences qui travaillent dans ce domaine font énormément. succès et comblent rapidement les lacunes dans notre compréhension des problèmes existants. Au cours des dernières décennies, l'humanité a appris que les cellules nerveuses se rétablissent et ont appris à reprogrammer les cellules souches afin qu'elles forment de nouveaux neurones [1]. Nous avons également constaté que grâce à la stimulation électrique des nerfs, la capacité de se déplacer indépendamment peut être restaurée chez les patients paralysés souffrant de lésions de la moelle épinière [2].De nombreuses maladies du système nerveux peuvent désormais être reconnues à un stade précoce et sans recours à des méthodes invasives ou à un long scan douloureux: une analyse relativement simple de l'information génétique d'une personne permet d'identifier de nombreuses maladies neurodégénératives, épilepsie et troubles du mouvement avant même l'apparition des symptômes. Il est devenu possible de créer des cartes détaillées et des bases de données accessibles au public contenant des informations sur la manière dont des gènes spécifiques sont associés à différentes maladies ou certains types de comportement, et sur la manière dont les interactions des produits de ces gènes sont impliquées dans le traitement d'un énorme flux d'informations dans le cerveau. Des mécanismes détaillés (au niveau du fonctionnement des neurones individuels) pour traiter les informations sur la localisation spatiale du corps ont été découverts - une sorte de GPS interne,fournir une orientation (pour ce travail a reçu le prix Nobel en 2014) [10].

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Figure 1. Approches ascendantes et descendantes.  Ces deux approches sont les extrêmes d'un continuum de chemins différents vers un objectif commun - expliquer exactement comment notre cerveau donne naissance à notre esprit.  En général, il existe actuellement une corrélation négative entre la précision cognitive et biologique des modèles.  Cependant, cette corrélation négative peut être transformée en une corrélation positive lorsque les limitations cognitives permettent une meilleure compréhension des fonctions biologiques et lorsque la biologie est l'inspiration pour créer des modèles qui expliquent les processus de pensée [3].
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. , in vitro , , . JetBrains Research (in silico) : BCNNM (Biological Cellular Neural Network Modeling), .

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Figure 2. Croissance et différenciation de la masse cellulaire pendant la simulation.
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Croissance cellulaire

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Croissance Axon

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Figure 3. Un exemple de dynamique cellulaire après une blessure dans un modèle.
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Computational Neuroscience

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  2. Angeli, C. A., Boakye, M., Morton, R. A., Vogt, J., Benton, K., Chen, Y., … Harkema, S. J. (2018). Recovery of Over-Ground Walking after Chronic Motor Complete Spinal Cord Injury. New England Journal of Medicine. doi:10.1056/NEJMoa1803588 (https://doi.org/10.1056/NEJMoa1803588)

  3. Kriegeskorte, N., & Douglas, P. K. (2018). Cognitive computational neuroscience. Nature Neuroscience. doi:10.1038/s41593-018-0210-5

  4. Caffrey, J. R., Hughes, B. D., Britto, J. M., and Landman, K. A. (2014). An in silico agent-based model demonstrates reelin function in directing lamination of neurons during cortical development. PLoS ONE 9. doi:10.1371/journal.pone.0110415

  5. Dingle, Y.-T. L., Boutin, M. E., Chirila, A. M., Livi, L. L., Labriola, N. R., Jakubek, L. M., et al. (2015). Three-dimensional neural spheroid culture: An in vitro model for cortical studies. Tissue engineering. Part C, Methods 21, 1274–1283. doi:10.1089/ten.TEC.2015.0135. 26414693

  6. Gerhard, F., Pipa, G., Lima, B., Neuenschwander, S., and Gerstner, W. (2011). Extraction of network topology from multi-electrode recordings: Is there a small-world effect? Frontiers in Computational Neuroscience 5. doi:10.3389/fncom.2011.00004

  7. .. . . , - 2018

  8. Wang, X., Gao, X., Michalski, S., Zhao, S., & Chen, J. (2016). Traumatic Brain Injury Severity Affects Neurogenesis in Adult Mouse Hippocampus. Journal of Neurotrauma, 33(8), 721–733. doi:10.1089/neu.2015.4097 (https://doi.org/10.1089/neu.2015.4097)

  9. Neuberger, E. J., Swietek, B., Corrubia, L., Prasanna, A., & Santhakumar, V. (2017). Enhanced Dentate Neurogenesis after Brain Injury Undermines Long-Term Neurogenic Potential and Promotes Seizure Susceptibility. Stem Cell Reports, 9(3), 972–984. doi:10.1016/j.stemcr.2017.07.015 (https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2017.07.015)

  10. https://www.scientificamerican.com/article/how-the-2014-nobel-prize-winners-found-the-brain-s-own-gps/




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